MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD06

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011889	GTG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011889	TCA	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011889	TC	3	6	1831	1836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011889	CCG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011889	CTT	2	6	1970	1975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011889	CGC	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011889	GCA	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011889	GGC	2	6	2065	2070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011889	ATG	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011889	GC	3	6	2101	2106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011889	GGCG	2	8	2766	2773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011889	ACGG	2	8	2833	2840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011889	CT	3	6	2851	2856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011889	ACGG	2	8	2883	2890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011889	GAAC	2	8	2897	2904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011889	ACC	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011889	CGGA	2	8	2977	2984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011889	GGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011889	CGG	3	9	4090	4098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011889	CCGAC	2	10	4117	4126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011889	C	7	7	4153	4159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_011889	CGTGG	2	10	4198	4207	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011889	GGC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011889	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011889	GTTC	2	8	4252	4259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011889	GTG	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011889	A	6	6	5266	5271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011889	AAT	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011889	CAACC	2	10	5324	5333	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_011889	CG	3	6	8011	8016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011889	G	6	6	8016	8021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011889	G	6	6	8024	8029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011889	G	6	6	8033	8038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011889	TACAA	2	10	8076	8085	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011889	GC	3	6	8550	8555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011889	GAG	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011889	CGT	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011889	GCG	2	6	8629	8634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011889	ATC	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011889	A	6	6	9292	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011889	CCA	2	6	9300	9305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011889	GGC	2	6	9309	9314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011889	CTC	2	6	9515	9520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011889	CAA	2	6	9522	9527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011889	CGT	2	6	9539	9544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011889	CAA	2	6	9553	9558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011889	TTC	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011889	A	6	6	9658	9663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011889	CGG	2	6	9684	9689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011889	TCG	2	6	9694	9699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011889	AAGT	2	8	9710	9717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011889	CA	3	6	9749	9754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011889	CAA	2	6	9756	9761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011889	A	6	6	9873	9878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011889	CCA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011889	TCA	3	9	9943	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011889	ACT	2	6	9958	9963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011889	ATC	2	6	10011	10016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011889	CTG	2	6	10118	10123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011889	GCA	2	6	10850	10855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011889	GCG	2	6	10918	10923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011889	C	6	6	10972	10977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_011889	GCG	3	9	11049	11057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011889	TCC	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011889	TCA	2	6	11094	11099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011889	CCA	2	6	11101	11106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011889	GCC	2	6	11156	11161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011889	GAC	2	6	11240	11245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011889	CCG	2	6	11275	11280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011889	GC	3	6	11342	11347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011889	CCTG	2	8	11380	11387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.